Theo thông tin được xác nhận từ Ubisoft, trò chơi Assassin's Creed Shadows sẽ có sẵn 2 nhân vật chính mà người chơi có thể lựa chọn. Ngoài Samurai Yasuke, bạn cũng có thể chơi với phong cách sát thủ của Ninja thực thụ là Naoe.
Naoe là một nhân vật hư cấu, là con gái của lãnh chúa Fujibayashi Nagato. Phong cách chơi của Naoe và Yasuke sẽ có sự khác biệt. Yasuke là một chiến binh Samurai can đảm trong khi Naoe là một ninja tài ba trong việc ẩn mình trong bóng tối. Đối với những người yêu thích phong cách hành động lén lút truyền thống của Assassin's Creed, Naoe sẽ là một nhân vật hấp dẫn không kém.
Trước đó, khả năng ẩn nấp của Assassin's Creed chủ yếu tập trung vào việc người chơi trốn trong các vật phẩm có thể ngụy trang hoặc che giấu bản thân, như cỏ rậm, đống cỏ khô, xe đẩy, đám đông đông đúc, vườn trên sân thượng, giếng... Tuy nhiên, Assassin's Creed Shadows sẽ giới thiệu một hệ thống chiếu hành động lén lút mới, dựa vào quy luật của ánh sáng. Khi ở trong bóng tối, nhân vật của bạn sẽ được che giấu khỏi tầm nhìn của kẻ thù.
Một chiếc đồng hồ đo ánh sáng sẽ được thêm vào giao diện người chơi của Assassin's Creed Shadows để thông báo cho họ biết họ đang ở trong ánh sáng hay bóng tối. Dường như nó sẽ hoạt động giống như hệ thống phát hiện truyền thống của Assassin's Creed.
Để đảm bảo một khu vực đủ tối để trốn tránh, người tham gia trò chơi có thể loại bỏ người cầm đuốc hoặc phá hủy đèn lồng do người hầu mang theo. Người hầu không thể tham gia vào cuộc chiến, nhưng nếu ngẫu nhiên phát hiện người chơi, họ sẽ kêu cứu và điều quân tiếp viện đến.
Trong Assassin's Creed Shadows, người chơi cũng có thể thực hiện nhiều phong cách chơi theo hướng hòa bình hơn nếu họ muốn, bằng cách thực hiện các cuộc hạ gục mà không làm chết kẻ thù.